Eigenmarken, die das Sortiment erweitern und nur bei Shop Apotheke verfügbar sind sowie ein Marktplatz bieten zusätzliche Produktauswahl und Alleinstellungsmerkmale gegenüber der Konkurrenz. Die Marktplatz-Lösung von Shop Apotheke ist aktuell in Deutschland und Österreich verfügbar. Sie erweitert das Produktportfolio ungemein und bietet Händlern von gesundheitsbezogenen Produkten, zum Beispiel aus den Bereichen Sanitätshaus, Sport und Fitness, Baby und Familie oder Drogerie und Haushalt eine Verkaufsplattform.